הוועדה הארצית לתכנון ולבנייה של תשתיות לאומיות הוקמה בחודש מאי 2002, במסגרת תיקון מס' 60 לחוק התכנון והבנייה, התשכ"ה -1965. הוועדה הוקמה במטרה ליצור גוף שיתמחה בקידום תוכניות תשתית, שיוגדרו ע"י הממשלה כתכניות תשתית לאומית, בלוח זמנים קצר.
קידום תחנות הכח באמצעות הות"ל מהווה דוגמא מובהקת לחולשה מובנית בהליך התכנון של הוועדה, הנעדרת ראייה כוללת של התוכניות הפרטניות כחלק ממדיניות ארצית כוללת. קידום פרטני של תחנות כח נעדר ראייה כוללת של משק האנרגיה בישראל.
הכבישים המתוכננים במסגרת הות"ל הם כבישים בעלי חשיבות לאומית, אך העברתם לתכנון בות"ל נעשתה, ברוב המקרים, לאחר שהחלו בקידומם במסגרת מערכת התכנון ה"רגילה" ושם נתקלו בקשיים, כגון התנגדות של הארגונים הסביבתיים או צורך לתאם בין מחוזות ורשויות שונים.
מסגרת התכנון של הועדה לתשתיות לאומיות (ות"ל) נועדה בפירוש לקידום תוכניות אשר דחיפותן גבוהה והן נדרשות לאישורים ב"מסלול מהיר". מסילות הרכבת המתוכננות במסגרת הות"ל אינן תכניות שעומדים לבצען בתקופה הקרובה, ולכן ניתן לטעון כי העברת תכניות מסילתיות לות"ל נעשית מטעמי נוחות בלבד.
ההפרדות המפלסיות בין הכבישים למסילות הרכבת בארץ הפכו מטרה תכנונית וביצועית לאחר התאונות המחרידות שאירעו בשנים האחרונות. משרד האוצר אישר תקציב ייעודי בסך כמה מיליארדי שקלים על מנת להפריד באופן מוחלט בין הכבישים למסילות. חלק מההפרדות תוכננו במסגרת מערכת התכנון ה"רגילה", אולם מאז העברת התקציב הועבר תכנון ההפרדות לות"ל.